瑞格菲尼的副作用主要涉及皮肤系统、血液系统、神经系统以及消化系统，瑞格菲尼可以造成出血、胃肠道穿孔、胃肠道瘘等症状，严重者可以危及生命，因此在用药期间应该监测血常规以及是否有出血或者黑便等症状。
应用瑞格菲尼可能会引起癫痫发作、头疼、视力障碍、意识模糊等神经系统副作用，瑞格非尼也可能会造成皮疹、斑丘疹、脱发、多形红斑等皮肤系统反应。
一旦出现请咨询专业医师是否应该停药，瑞格菲尼可能会出现严重的甚至致命的肝毒性，因此在用药之前可在用药过程中应该持续监测肝功能。一旦出现肝功能的损害，患者应立即到正规医疗机构咨询专业医师意见。
